多普勒超声在人上应用最多，在奶牛上国内尚未报道。但国外有人应用多普勒超声在奶牛的繁殖中用于跟踪卵泡排卵前的周期变化情况，多普勒彩色流体声像图可以获得卵泡壁上血液的流速，对奶牛卵泡囊肿和黄体囊肿可做出诊断，多普勒超声诊断奶牛黄体囊肿的准确率比牛用B超的要高。

在诊断奶牛卵巢囊肿时有一项形态指标需要测量那就是卵泡壁的厚度，诊断卵泡囊肿和黄体囊肿以卵泡壁的厚度是否大于或小于3mm 作为一项判断指标，然而牛用B超能否测量卵泡壁的厚度受卵泡直径的限制，只有当卵泡的直径超过15mm 时才能对卵泡壁的厚度以及卵泡的面积进行牛用B超测量。

牛用B超虽然可以测量卵泡的大小，但对于卵泡壁的厚度和卵泡壁的反射值却不能测定，应用核磁共振根据卵巢囊肿和正常卵巢壁的厚度和反射强度不同可以对此作出准确的诊断，核磁共振技术是诊断卵泡囊肿和黄体囊肿较为精确的手段。

核磁共振还可以过滤周围的噪音，其分辨率更加优于牛用B超，甚至可以将卵巢上的黄体和卵巢基质两种反射强度几乎相同的结构区分出来，因此核磁共振也是今后诊断奶牛卵巢的一项新技术。