前列腺素处理后将使母牛卵巢中的黄体退化。一些牛发情后5-6天的黄体就对前列腺素有反应，但多数牛在发情后7-8天才对前列腺素有反应。在牛用B超上观察时，处理后的母牛黄体开始体积萎缩。

当在发情周期的晚期如发情17天处理时，母牛卵巢中黄体就会靠自身所分泌的前列腺素使其退化，牛用B超上几乎看不到黄体的形状。

从前列腺素处理到排卵的时间受卵泡的生理状况决定，母牛发情后6天用前列腺素处理时，第一个卵泡波优势卵泡继续发育，那么从前列腺素处理到排卵时间平均为3天，在牛用B超上可以看到卵泡的发育过程。

当母牛发情后13天，用前列腺素处理时，正处在第二卵泡波优势卵泡发育的早期，那么从前列腺素处理到排卵时间平均为3.5天;大多数母牛发情后9天前列腺素处理时，第一卵泡波形成的优势卵泡排卵平均时间为前列腺素处理后的第4天。而一些牛在发情后9天前列腺素处理时，正处在第二卵泡波优势卵泡刚刚开始，那么到第二卵泡波优势卵泡发育成熟并排卵需要6天时间，在发情周期的不同阶段前列腺素处理影响母牛的妊娠率。